入门
基于 google-deepmind/science-skills 主分支（2026-07）的 README、SKILL_LICENSES.md 与 skills/ 编写。
速查
- 装：
npx skills add google-deepmind/science-skills（Claude Code / Cursor / Codex / Antigravity 等）；或 Antigravity 在「Build with Google」勾选 Science - 38 个 skill：结构生物学（alphafold-db/foldseek/pdb/uniprot）、基因组（alphagenome/clinvar/gnomad/dbsnp/jaspar/encode-ccres/gtex/ensembl）、化学药物（chembl/pubchem/openfda）、文献（arxiv/biorxiv/europepmc/openalex/pubmed）、序列（ncbi-fetch/msa/similarity-search）、其它数据库（clinical-trials/opentargets/human-protein-atlas/interpro/quickgo/reactome/string/unibind/embl-ebi-ols/ucsc）、工具（pymol/predictingthepast/uv/workflow-skill-creator/credentials）
- 前置：
uv包管理器（首次触发自动装）；AlphaGenome/OpenAlex 必须 API key，ClinVar 等有 key 提速 - 许可：软件 Apache-2.0；调用的各数据库各有许可（见
SKILL_LICENSES.md） - 统一模式：每 skill = SKILL.md + scripts/ + references/；脚本统一
uv run，自动 rate-limit
安装
两种途径：
bash
# 通用：skills.sh CLI
npx skills add google-deepmind/science-skills- 新用户：下载 Antigravity 后在「Build with Google」步骤勾选 Science，即装整套 curated collection
- 老用户：设置 → Customizations → Build with Google Plugins → 下载
Scienceplugin
Prerequisites
uv包管理器：所有脚本经uv run跑，首次触发某个 Science Skill 时 agent 会请求批准并装uv，装完建议重启 Antigravity- API key（部分 skill 必须）：AlphaGenome、OpenAlex 必须有 key 才能跑；ClinVar 等有 key 可提速率但非必须
- 写 key 的位置：
~/.env，例如echo "ALPHAGENOME_API_KEY=your_actual_api_key" >> ~/.env credentialsskill：用统一安全凭据协议请求/检查 key，不要手硬编码
自定义或新建 skill
不要直接改 Antigravity Science plugin 安装目录的文件（plugin 更新会覆盖），把自定义 skill 放在：
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~/.gemini/config/skills/38 个 skill 分类速览
| 领域 | 代表 skill | 一句话 |
|---|---|---|
| 结构生物学 | alphafold_database_fetch_and_analyze | 给 UniProt ID 拉 AlphaFold mmCIF + PAE，自动判 pLDDT/域边界 |
foldseek_structural_search | 按结构（非序列）搜同源折叠 | |
pdb_database | 查 RCSB PDB 实验结构 | |
uniprot_database | 蛋白质序列与注释 | |
| 基因组学 | alphagenome_single_variant_analysis | 非编码变异对表达/剪接/染色质的影响（需 key） |
clinvar_database / gnomad_database / dbsnp_database | 临床意义 / 群体频率 / 已知变异 | |
jaspar_database / encode_ccres_database | 转录因子结合 motif / 顺式调控元件 | |
gtex_database / ensembl_database | 组织表达 / 基因组注释 | |
| 化学/药物 | chembl_database / pubchem_database / openfda_database | 药物活性 / 化合物 / FDA 不良反应 |
| 文献检索 | literature_search_arxiv / literature_search_biorxiv | 预印本搜索与全文下载 |
literature_search_europepmc / literature_search_openalex / pubmed_database | 全文/引用图谱/生物医学文献 | |
| 序列分析 | ncbi_sequence_fetch / protein_sequence_msa / protein_sequence_similarity_search | 拉序列 / 多序列比对 / BLAST |
| 分子可视化 | pymol | 渲染蛋白结构（cartoon / pLDDT 着色 / 配体互作 / 表面） |
| 其它数据库 | clinical_trials_database / opentargets_database / human_protein_atlas_database / interpro_database / quickgo_database / reactome_database / string_database / unibind_database / embl_ebi_ols / ucsc_conservation_and_tfbs | 临床试验 / 靶点 / 蛋白图谱 / 结构域 / GO / 通路 / PPI / 调控 / 本体 / 保守性 |
| 基础设施 | uv / credentials / workflow_skill_creator / predictingthepast | 依赖管理 / 凭据 / 自建 skill / 古文本修复·断代（Aeneas/Ithaca） |
工作流速览：装好第一次用
- 装：
npx skills add google-deepmind/science-skills - 触发：自然语言描述任务，例如「给我 P00520 的 AlphaFold 结构并分析置信度」
- 首次：agent 申请装
uv（约 10s），之后脚本缓存秒开 - 如需 key：agent 引导你注册并写入
~/.env（AlphaGenome 等必须） - 跑：agent 调对应 skill 的
scripts/，自动 rate-limit、产出文件与摘要 - 合规提醒：首次用某 skill，agent 在工作区
.licenses/落 LICENSE.txt 并提醒你看上游条款